No es posible crear una nueva liga. Lo que debes hacer es retocar una liga con el editor. En tu caso, quieres añadir la liga ecuatoriana, por lo que te recomiendo que edites una liga sudamericana (Uruguay, Chile, Colombia) con un sistema parecido al ecuatoriano en número de equipos, ascensos, clasificación continental... Lo que tienes que hacer es cambiar el nombre de la liga, el país en el que se disputa, y cambiar los equipos que la forman, sustituyendo ecuatorianos por uruguayos (por poner un ejemplo). Ojo, mira bien que tenga la misma cantidad de equipos que antes, y que incluso los equipos de las divisiones inferiores también hayan sido cambiados, ya que esto podría originar incompatibilidades.
Si tienes alguna duda más, no dudes en ir preguntándolo aquí, porque modificar una liga existente y sustituirla por otra lleva bastante trabajo y puede dar muchos problemas, y a decir verdad, yo hace que no edito una liga desde el FM2006